Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdzrn3Q69ZS0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdzrn3Q69ZS0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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