Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ric1Q69ZJ7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ric1Q69ZJ7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ric1Q69ZJ7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ric1Q69ZJ7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ric1Q69ZJ7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ric1Q69ZJ7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ric1Q69ZJ7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ric1Q69ZJ7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms