Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

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Length 577 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Msl2Q69ZF8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms