Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Pkp4Q68FH0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms