Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kiaa1549Q68FD9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kiaa1549Q68FD9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms