Protein–RNA interactions for Protein: Q66X05

Nlrp4f, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4fQ66X05 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp4fQ66X05 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms