Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms