Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt12Q64291 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt12Q64291 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms