Protein–RNA interactions for Protein: Q640N1

Aebp1, Adipocyte enhancer-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aebp1Q640N1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Aebp1Q640N1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Aebp1Q640N1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms