Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou4f3Q63955 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms