Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf260Q62513 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf260Q62513 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf260Q62513 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf260Q62513 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf260Q62513 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf260Q62513 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Znf260Q62513 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf260Q62513 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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