Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CochQ62507 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CochQ62507 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CochQ62507 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CochQ62507 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CochQ62507 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CochQ62507 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CochQ62507 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CochQ62507 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CochQ62507 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CochQ62507 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CochQ62507 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CochQ62507 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CochQ62507 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CochQ62507 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CochQ62507 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CochQ62507 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CochQ62507 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CochQ62507 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CochQ62507 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CochQ62507 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CochQ62507 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CochQ62507 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CochQ62507 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CochQ62507 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CochQ62507 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CochQ62507 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CochQ62507 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CochQ62507 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CochQ62507 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CochQ62507 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CochQ62507 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CochQ62507 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CochQ62507 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CochQ62507 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CochQ62507 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CochQ62507 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CochQ62507 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CochQ62507 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CochQ62507 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CochQ62507 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CochQ62507 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CochQ62507 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CochQ62507 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CochQ62507 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CochQ62507 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CochQ62507 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CochQ62507 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CochQ62507 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CochQ62507 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CochQ62507 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CochQ62507 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CochQ62507 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CochQ62507 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CochQ62507 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CochQ62507 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CochQ62507 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CochQ62507 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CochQ62507 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CochQ62507 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CochQ62507 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CochQ62507 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CochQ62507 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CochQ62507 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CochQ62507 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CochQ62507 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CochQ62507 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CochQ62507 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CochQ62507 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CochQ62507 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CochQ62507 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CochQ62507 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CochQ62507 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CochQ62507 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CochQ62507 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CochQ62507 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CochQ62507 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CochQ62507 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CochQ62507 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CochQ62507 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CochQ62507 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CochQ62507 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CochQ62507 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CochQ62507 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CochQ62507 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CochQ62507 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CochQ62507 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CochQ62507 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CochQ62507 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CochQ62507 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CochQ62507 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CochQ62507 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CochQ62507 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CochQ62507 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CochQ62507 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CochQ62507 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CochQ62507 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CochQ62507 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CochQ62507 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CochQ62507 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms