Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn4Q62472 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn4Q62472 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn4Q62472 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn4Q62472 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn4Q62472 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn4Q62472 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn4Q62472 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn4Q62472 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn4Q62472 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn4Q62472 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn4Q62472 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn4Q62472 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn4Q62472 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn4Q62472 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn4Q62472 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn4Q62472 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn4Q62472 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn4Q62472 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn4Q62472 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn4Q62472 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn4Q62472 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn4Q62472 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn4Q62472 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn4Q62472 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn4Q62472 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn4Q62472 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn4Q62472 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn4Q62472 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn4Q62472 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn4Q62472 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn4Q62472 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn4Q62472 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn4Q62472 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn4Q62472 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn4Q62472 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn4Q62472 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn4Q62472 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcn4Q62472 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcn4Q62472 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcn4Q62472 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcn4Q62472 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcn4Q62472 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcn4Q62472 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcn4Q62472 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms