Protein–RNA interactions for Protein: Q62440

Tle1, Transducin-like enhancer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tle1Q62440 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tle1Q62440 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms