Protein–RNA interactions for Protein: Q62420

Sh3gl2, Endophilin-A1, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3gl2Q62420 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3gl2Q62420 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3gl2Q62420 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3gl2Q62420 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3gl2Q62420 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3gl2Q62420 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3gl2Q62420 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3gl2Q62420 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3gl2Q62420 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3gl2Q62420 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3gl2Q62420 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3gl2Q62420 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3gl2Q62420 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3gl2Q62420 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3gl2Q62420 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3gl2Q62420 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3gl2Q62420 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3gl2Q62420 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3gl2Q62420 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3gl2Q62420 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3gl2Q62420 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3gl2Q62420 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3gl2Q62420 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3gl2Q62420 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3gl2Q62420 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3gl2Q62420 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3gl2Q62420 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3gl2Q62420 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3gl2Q62420 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3gl2Q62420 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3gl2Q62420 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3gl2Q62420 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3gl2Q62420 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3gl2Q62420 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3gl2Q62420 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3gl2Q62420 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms