Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tff3Q62395 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff3Q62395 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms