Protein–RNA interactions for Protein: Q62376

Snrnp70, U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp70Q62376 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp70Q62376 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snrnp70Q62376 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snrnp70Q62376 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snrnp70Q62376 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Snrnp70Q62376 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snrnp70Q62376 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snrnp70Q62376 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp70Q62376 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp70Q62376 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp70Q62376 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp70Q62376 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp70Q62376 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp70Q62376 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp70Q62376 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp70Q62376 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp70Q62376 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp70Q62376 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp70Q62376 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp70Q62376 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp70Q62376 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp70Q62376 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp70Q62376 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp70Q62376 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp70Q62376 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms