Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sprr1bQ62267 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms