Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sall3Q62255 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sall3Q62255 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms