Protein–RNA interactions for Protein: Q62219

Tgfb1i1, Transforming growth factor beta-1-induced transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1i1Q62219 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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Tgfb1i1Q62219 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgfb1i1Q62219 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
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Tgfb1i1Q62219 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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Tgfb1i1Q62219 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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Tgfb1i1Q62219 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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Tgfb1i1Q62219 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
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Tgfb1i1Q62219 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Tgfb1i1Q62219 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgfb1i1Q62219 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms