Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sin3bQ62141 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sin3bQ62141 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms