Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms