Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gli3Q61602 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gli3Q61602 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gli3Q61602 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gli3Q61602 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gli3Q61602 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gli3Q61602 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gli3Q61602 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gli3Q61602 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gli3Q61602 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gli3Q61602 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gli3Q61602 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gli3Q61602 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gli3Q61602 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gli3Q61602 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gli3Q61602 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gli3Q61602 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gli3Q61602 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gli3Q61602 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gli3Q61602 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gli3Q61602 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gli3Q61602 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gli3Q61602 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gli3Q61602 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gli3Q61602 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gli3Q61602 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gli3Q61602 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gli3Q61602 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gli3Q61602 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms