Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnna2Q61301 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnna2Q61301 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnna2Q61301 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnna2Q61301 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnna2Q61301 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnna2Q61301 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnna2Q61301 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnna2Q61301 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnna2Q61301 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnna2Q61301 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnna2Q61301 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnna2Q61301 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnna2Q61301 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnna2Q61301 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnna2Q61301 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnna2Q61301 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnna2Q61301 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnna2Q61301 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnna2Q61301 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnna2Q61301 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnna2Q61301 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnna2Q61301 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnna2Q61301 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnna2Q61301 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnna2Q61301 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnna2Q61301 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctnna2Q61301 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctnna2Q61301 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctnna2Q61301 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctnna2Q61301 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctnna2Q61301 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctnna2Q61301 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctnna2Q61301 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctnna2Q61301 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms