Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prpf4bQ61136 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Prpf4bQ61136 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Prpf4bQ61136 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Prpf4bQ61136 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Prpf4bQ61136 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Prpf4bQ61136 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Prpf4bQ61136 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Prpf4bQ61136 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prpf4bQ61136 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prpf4bQ61136 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Prpf4bQ61136 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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