Protein–RNA interactions for Protein: Q61080

Foxf1, Forkhead box protein F1, mousemouse

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxf1Q61080 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Foxf1Q61080 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Foxf1Q61080 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxf1Q61080 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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