Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxd3Q61060 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxd3Q61060 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxd3Q61060 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxd3Q61060 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxd3Q61060 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Foxd3Q61060 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Foxd3Q61060 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Foxd3Q61060 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Foxd3Q61060 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Foxd3Q61060 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Foxd3Q61060 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd3Q61060 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms