Protein–RNA interactions for Protein: Q61003

Cd6, T-cell differentiation antigen CD6, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd6Q61003 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd6Q61003 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd6Q61003 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd6Q61003 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd6Q61003 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd6Q61003 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd6Q61003 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd6Q61003 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd6Q61003 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd6Q61003 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd6Q61003 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd6Q61003 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd6Q61003 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd6Q61003 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms