Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms