Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp7Q60973 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms