Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grik1Q60934 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grik1Q60934 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grik1Q60934 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grik1Q60934 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grik1Q60934 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grik1Q60934 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Grik1Q60934 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grik1Q60934 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grik1Q60934 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grik1Q60934 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grik1Q60934 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik1Q60934 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik1Q60934 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik1Q60934 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik1Q60934 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik1Q60934 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik1Q60934 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik1Q60934 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik1Q60934 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik1Q60934 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik1Q60934 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik1Q60934 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik1Q60934 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik1Q60934 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik1Q60934 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik1Q60934 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik1Q60934 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik1Q60934 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik1Q60934 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik1Q60934 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik1Q60934 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik1Q60934 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik1Q60934 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik1Q60934 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik1Q60934 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik1Q60934 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik1Q60934 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik1Q60934 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms