Protein–RNA interactions for Protein: Q60848

Hells, Lymphocyte-specific helicase, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HellsQ60848 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HellsQ60848 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HellsQ60848 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HellsQ60848 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HellsQ60848 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HellsQ60848 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HellsQ60848 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HellsQ60848 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HellsQ60848 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HellsQ60848 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HellsQ60848 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HellsQ60848 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HellsQ60848 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HellsQ60848 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HellsQ60848 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HellsQ60848 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HellsQ60848 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HellsQ60848 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HellsQ60848 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HellsQ60848 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HellsQ60848 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HellsQ60848 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HellsQ60848 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HellsQ60848 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HellsQ60848 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HellsQ60848 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HellsQ60848 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HellsQ60848 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HellsQ60848 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HellsQ60848 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HellsQ60848 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HellsQ60848 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HellsQ60848 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HellsQ60848 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HellsQ60848 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms