Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppp1r1bQ60829 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ppp1r1bQ60829 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ppp1r1bQ60829 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ppp1r1bQ60829 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ppp1r1bQ60829 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ppp1r1bQ60829 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ppp1r1bQ60829 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ppp1r1bQ60829 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ppp1r1bQ60829 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppp1r1bQ60829 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppp1r1bQ60829 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppp1r1bQ60829 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppp1r1bQ60829 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppp1r1bQ60829 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppp1r1bQ60829 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppp1r1bQ60829 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppp1r1bQ60829 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppp1r1bQ60829 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppp1r1bQ60829 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppp1r1bQ60829 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppp1r1bQ60829 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppp1r1bQ60829 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppp1r1bQ60829 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppp1r1bQ60829 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppp1r1bQ60829 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppp1r1bQ60829 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppp1r1bQ60829 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppp1r1bQ60829 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppp1r1bQ60829 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms