Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms