Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mkrn3Q60764 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mkrn3Q60764 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mkrn3Q60764 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mkrn3Q60764 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mkrn3Q60764 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mkrn3Q60764 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mkrn3Q60764 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mkrn3Q60764 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mkrn3Q60764 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mkrn3Q60764 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mkrn3Q60764 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mkrn3Q60764 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mkrn3Q60764 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mkrn3Q60764 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mkrn3Q60764 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mkrn3Q60764 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mkrn3Q60764 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mkrn3Q60764 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mkrn3Q60764 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mkrn3Q60764 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Mkrn3Q60764 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mkrn3Q60764 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mkrn3Q60764 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mkrn3Q60764 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mkrn3Q60764 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mkrn3Q60764 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mkrn3Q60764 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mkrn3Q60764 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mkrn3Q60764 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mkrn3Q60764 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mkrn3Q60764 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mkrn3Q60764 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mkrn3Q60764 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Mkrn3Q60764 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mkrn3Q60764 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Mkrn3Q60764 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mkrn3Q60764 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mkrn3Q60764 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mkrn3Q60764 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mkrn3Q60764 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mkrn3Q60764 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mkrn3Q60764 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms