Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epha1Q60750 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epha1Q60750 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epha1Q60750 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epha1Q60750 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epha1Q60750 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha1Q60750 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha1Q60750 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha1Q60750 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha1Q60750 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha1Q60750 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha1Q60750 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha1Q60750 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha1Q60750 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha1Q60750 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha1Q60750 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha1Q60750 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha1Q60750 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha1Q60750 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha1Q60750 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha1Q60750 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha1Q60750 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha1Q60750 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha1Q60750 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Epha1Q60750 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms