Protein–RNA interactions for Protein: Q60696

Pmel, Melanocyte protein PMEL, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmelQ60696 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PmelQ60696 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PmelQ60696 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PmelQ60696 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PmelQ60696 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PmelQ60696 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PmelQ60696 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PmelQ60696 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms