Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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PtprnQ60673 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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PtprnQ60673 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms