Protein–RNA interactions for Protein: Q60648

Gm2a, Ganglioside GM2 activator, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2aQ60648 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2aQ60648 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms