Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tnfsf15Q5UBV8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf15Q5UBV8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms