Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc5a6Q5U4D8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms