Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc125Q5U465 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms