Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bbs12Q5SUD9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bbs12Q5SUD9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bbs12Q5SUD9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bbs12Q5SUD9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bbs12Q5SUD9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Bbs12Q5SUD9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bbs12Q5SUD9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Bbs12Q5SUD9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bbs12Q5SUD9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Bbs12Q5SUD9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Bbs12Q5SUD9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Bbs12Q5SUD9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bbs12Q5SUD9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bbs12Q5SUD9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bbs12Q5SUD9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bbs12Q5SUD9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bbs12Q5SUD9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bbs12Q5SUD9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bbs12Q5SUD9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bbs12Q5SUD9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs12Q5SUD9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs12Q5SUD9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs12Q5SUD9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs12Q5SUD9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs12Q5SUD9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs12Q5SUD9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs12Q5SUD9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs12Q5SUD9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs12Q5SUD9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs12Q5SUD9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs12Q5SUD9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs12Q5SUD9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs12Q5SUD9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs12Q5SUD9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs12Q5SUD9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs12Q5SUD9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbs12Q5SUD9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bbs12Q5SUD9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bbs12Q5SUD9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bbs12Q5SUD9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bbs12Q5SUD9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bbs12Q5SUD9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Bbs12Q5SUD9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms