Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ7

Znrf3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf3Q5SSZ7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znrf3Q5SSZ7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znrf3Q5SSZ7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znrf3Q5SSZ7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znrf3Q5SSZ7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znrf3Q5SSZ7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms