Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psme4Q5SSW2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms