Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms