Protein–RNA interactions for Protein: Q5S248

Tmprss11e, Transmembrane protease serine 11E, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11eQ5S248 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmprss11eQ5S248 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmprss11eQ5S248 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmprss11eQ5S248 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmprss11eQ5S248 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmprss11eQ5S248 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmprss11eQ5S248 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmprss11eQ5S248 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmprss11eQ5S248 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmprss11eQ5S248 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmprss11eQ5S248 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmprss11eQ5S248 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmprss11eQ5S248 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmprss11eQ5S248 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmprss11eQ5S248 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmprss11eQ5S248 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmprss11eQ5S248 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmprss11eQ5S248 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmprss11eQ5S248 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmprss11eQ5S248 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmprss11eQ5S248 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmprss11eQ5S248 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmprss11eQ5S248 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmprss11eQ5S248 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmprss11eQ5S248 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmprss11eQ5S248 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmprss11eQ5S248 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmprss11eQ5S248 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmprss11eQ5S248 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmprss11eQ5S248 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmprss11eQ5S248 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmprss11eQ5S248 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms