Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCY0

Kdm6b, Lysine-specific demethylase 6B, mousemouse

Predictions only

Length 1,641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6bQ5NCY0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm6bQ5NCY0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm6bQ5NCY0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm6bQ5NCY0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm6bQ5NCY0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Kdm6bQ5NCY0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms