Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim58Q5NCC9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim58Q5NCC9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim58Q5NCC9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim58Q5NCC9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim58Q5NCC9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim58Q5NCC9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim58Q5NCC9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim58Q5NCC9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim58Q5NCC9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim58Q5NCC9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim58Q5NCC9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim58Q5NCC9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim58Q5NCC9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim58Q5NCC9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim58Q5NCC9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim58Q5NCC9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim58Q5NCC9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim58Q5NCC9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms