Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms